En el marco del cumplimiento de los derechos territoriales en pueblos étnicos existe lo que se denomina rezagos administrativos sobre los procesos que se tramitan ante la ANT. El artículo se centra en analizar la respuesta institucional de la ANT a los procesos de implementación de la política de Formalización y Protección de territorios ancestrales en siete comunidades indígenas ubicadas en la Altillanura colombiana, para valorar la existencia o no de violación de Derechos humanos y territoriales a estos pueblos. A través de una metodología cualitativa y en lógica normativa, se realizaron entrevistas semiestructuradas a líderes étnicos de los asentamientos y resguardos de las comunidades indígenas con procesos de Protección y/o Formalización, contrastando esta información con el análisis de la respuesta institucional a peticiones y estudios en la materia. Se concluye que, a pesar de los mecanismos creados para la implementación de la ley, estos no responden a los propósitos y alcances de los derechos territoriales indígenas, violando los Derechos Humanos de los pueblos indígenas y perpetuando la existencia de un modelo vertical de establecimiento burocrático y técnico del Estado.