El objetivo del artículo es presentar el “Diseño de un modelo de planeación prospectiva-estratégica para la formulación, implementación, ejecución y evaluación de planes de desarrollo aplicable a instituciones públicas de educación superior en Colombia”. El problema de investigación surgió del estudio de caso en una IES pública del orden municipal, que presentaba dificultades para gestionar el plan de desarrollo debido a la desarticulación orgánica entre las diferentes áreas de gestión y los procesos institucionales. La metodología se basó en la participación ciudadana para la realización del diagnóstico estratégico; así como en la aplicación del marco lógico y la metodología general ajustada. Los resultados evidencian el valor agregado alcanzado por la entidad objeto de la intervención de dos maneras: los espacios de participación hicieron más confiable el diagnóstico realizado, y la innovación del diseño y ejecución de proyectos que pasó a ser más dinámica y multidisciplinaria. La utilidad de los resultados muestra que el modelo de planeación prospectiva-estratégica diseñado para la formulación, implementación, ejecución y evaluación del Plan de Desarrollo en la IES objeto de investigación-intervención es aplicable a instituciones públicas de educación superior en Colombia.